Plusieurs vulnérabilités ont été identifiées dans eMule X-Ray, elles pourraient être exploitées par de attaquants afin de causer un déni de service ou compromettre un système vulnérable. Ces failles résultent d'une corruption de mémoire présente au niveau du serveur web ainsi que d'un débordement de mémoire présent dans Uploadlist, ce qui pourrait permettre à des attaquants d'altérer le fonctionnement d'une application vulnérable ou d'exécuter un code arbitraire.